肝门胆管癌属于恶性肿瘤，该疾病的特殊位置，导致手术的风险很大。
对于该疾病是不建议采取腹腔镜下手术治疗，如果需要手术或者可以手术，是需要采取开腹手术治疗。肝门胆管癌可以说明患者病灶位于肝门部胆管上，如果患者病灶位于左肝管上，是可以考虑手术治疗。但是病灶位于右肝管及肝总管上，手术切除的机会不大，且风险很大。
肝门部胆管癌即使开腹手术治疗，主要还是需要放置U型管外引流，使其胆汁能够排出，从而减轻患者的黄疸及不适的症状。黄疸症状改善后，可以针对肿瘤采取介入动脉灌注化疗，或者采取靶向药物治疗。