慢性咳嗽和过敏性咳嗽的区别在于：
慢性咳嗽可以包含过敏性咳嗽，而过敏性咳嗽不一定会引起慢性咳嗽。同时在疾病治疗上，慢性咳嗽主要是根据引起疾病的诱因来进行治疗。而过敏性咳嗽一般使用抗组胺药物，降低气道敏感性的药物就可以改善了。
并且过敏性咳嗽如果久治不愈，最终可以导致支气管哮喘的风险。而慢性咳嗽一般是不会出现严重的并发症的。
所以，如果患者无法区分这两种疾病，还是建议在医师的判断和指导下明确病因，然后选择针对性治疗，从而改善患者临床症状。