肠系膜静脉血栓形成是占到了这个肠系膜血管缺血性疾病的5%到15%，它通常累积到了肠系膜上静脉而非肠系膜下静脉，该病在临床上发病比较隐匿，诊断往往被延误，大部分的患者是因为在开腹探查时才明确诊断的。
急性肠系膜上静脉血栓形成的临床表现都有腹痛不适，还有这个排便规律的改变等前期的症状。这个时期患者的症状不典型，查体也没有明显的体征，仅表现在不确定的腹部深压痛，各种化验检查也没有特异性的变化。此时诊断肠系膜上静脉血栓形成很困难。随着病进入了进展期，病程发展的速度也明显加快，患者的症状多会突然间加重，腹痛剧烈，成为持续性，但是定位不确切。
一般来说的这个止疼药都是没有效果的，需要比较强的镇痛药，比如说杜冷丁、吗啡方能暂时的缓解，并且伴有腹胀、恶心、呕吐，在进展早期患者的症状明显加重，但是体征比较少，通常没有明显的腹肌紧张或者腹部的压痛、反跳痛等这些抚摸刺激的症状，随着肠管缺血逐渐加重，肠壁水肿渗出容易继发腹膜炎，才会出现相应的体征。