咬肌间隙感染反复发作，主要是由于病因未消除造成的，患者需要查明病因后，针对病因进行治疗。
导致咬肌间隙感染的原因有很多，可能是下颌智齿冠周炎，以及下颌磨牙的根尖周炎、牙槽脓肿引起的，也可能是磨牙后三角区黏膜感染，以及相邻间隙感染扩散造成的，还有少部分患者是由化脓性腮腺炎引发的。因此，咬肌间隙感染在进行手术治疗以及药物治疗后，还需针对具体的病因进行治疗。
如果是由智齿冠周炎引起的，最好及早将智齿拔除。如果是由根尖周炎引发的，应及早进行根管治疗。只有将病因消除后，才可避免咬肌间隙感染的反复发作。