自然流产如何排干净，与自然流产的类型有关。
如果是不完全流产，在确诊以后应当尽快进行刮宫术，将子宫内的胚胎组织进行清除。如果出血量大，并且还伴有休克，应及时进行抗休克治疗，也要预防性使用抗生素，避免出现感染。
如果存在难免流产，可以使用缩宫素促进子宫收缩。例如胎盘以及胚胎组织向外排出，在必要时也需要进行清宫手术。如果存在稽留流产，由于胚胎已经停止发育、刮宫较困难，可以先进行药流，然后进行人工流产，能够降低残留组织的风险。