华支睾吸虫病和血吸虫病的区别主要在以下几点：
首先，华支睾吸虫病和血吸虫病的病原不同。华支睾吸虫病的病原为华支睾吸虫；血吸虫病的病原为日本血吸虫。
其次，两种疾病的病变位置不同。华支睾吸虫病的病变位置都为胆道内；血吸虫病的病变位置多位于门静脉系统。
第三，两种疾病的感染途径不同。华支睾吸虫病的感染途径常为生的淡水鱼、虾；血吸虫病的感染途径为钉螺。
第四，两种疾病的临床表现差异较大。血吸虫病可以早期引起门脉高压。