得了肛瘘后是能控制自己的排便的，因为肛瘘由三部分构成，即内口、瘘管和外口。
内口位于肛内的肛隐窝处，外口位于肛周的皮肤上，瘘管走行于肛门周围的肌肉组织间隙内，如果不发生严重的感染，不会影响到肛门括约肌的功能，从而患者能很好的控制自己的排便。
如果肛瘘的感染很严重，发生了新的脓肿，压迫肛门括约肌，从而出现排便困难，甚至是不能排便，这时应及时行手术治疗，行肛周脓肿切开术或肛周脓肿根治术，以缓解排便困难的情况。