脑血栓发病早期主要是通过药物治疗。
首先，有溶栓适应证的，应在治疗窗之内，立即进行溶栓治疗，时间就是大脑。如果溶栓成功后，血管再通，神经功能可能恢复。在溶栓治疗24小时以后，可进行抗血小板聚集治疗，其他治疗还包括脑保护、改善循环等。
其次，在脑血栓发病早期，病情平稳的时候应进行康复治疗。早期通过现代康复治疗、传统中医治疗，可以改善患者缺血的神经功能。脑血栓具有高发病率、高致残率等特点，早期及时治疗是病情恢复的关键。