肥厚型心肌病存活时间与患者病情的轻重、是否得到了有效的治疗有关。如果肥厚型心肌病没有流出道的梗阻，或者发现以后及时地使用药物治疗，或者介入治疗，手术治疗的方法改善了心脏的舒张功能，这种情况患者可以存活许多年都没有问题。
肥厚性心肌病的主要危险，就是容易出现恶性心律失常，或者导致患者猝死的发生。通过积极的药物治疗或者介入治疗，可以有效预防这些不良并发症的发生。
反之，如果肥厚性心肌病没有发现或者发现以后，没有及时采取有效的措施进行治疗，患者的心脏功能将会受到明显的影响，有些患者还会出现猝死的现象。