肛门有很多小疙瘩，可能是患肛门湿疹。肛门湿疹是发生在肛门和肛周的过敏性变态反应性的皮肤病，肛周会出现瘙痒。肛门局部会出现丘疹样的小疙瘩，小疙瘩会连成片状，还会出现红斑、渗出、糜烂和脱屑。
得肛门湿疹要口服或注射抗过敏药物，炎症较重时可使用激素类药和抗生素，肛门局部可外涂除湿止痒的药膏。慢性湿疹也可以采用手术治疗，行肛周皮下神经离断术。
肛门有很多小疙瘩，还可能是患肛周尖锐湿疣。肛周会出现很多的疣体，类似小疙瘩。疣体可呈皮色、白色或红色，突出于皮肤及黏膜，可有乳头状、鸡冠状、菜花状等形态，底部常有蒂。尖锐湿疣一般采取手术、激光、冷冻、微波的方法切除。