早上起来喉咙有痰，可能是慢性咽炎、鼻炎、鼻窦炎等原因引起。
经常用嗓过度，处于有粉尘、刺激气味的环境中生活，经常吸烟、喝酒等因素形成慢性咽炎。咽喉局部经常充血，黏性分泌物增多依附在咽后壁，引起早上起来时感觉喉咙有痰，有异物感经常想清嗓子。鼻炎、鼻窦炎由于晚上睡觉时，鼻部的分泌物会倒流入咽喉，也会造成早上起来感觉喉咙有痰，伴有刺激性的咳嗽。
受到细菌或者病毒感染造成急性咽喉炎，也可导致咽喉部位的分泌物增多，引起有痰液伴有咽喉疼痛。