男性分段排尿，先要明确病因，应用药物治疗或手术治疗原发病。男性分段排尿，也就是排尿突然中断，经过体位改变和走动，又能排出尿液，通常见于膀胱结石、输尿管囊肿、膀胱憩室。
如果膀胱结石压迫膀胱颈口引起，结石不大，可通过服用排石药物，大量喝水，通过尿流推动的作用，促进结石通过尿道排出。结石较大，可在膀胱镜下做碎石术、取石术治疗，促进排尿通畅。如果输尿管囊肿引起，需要做手术解除梗阻。
膀胱憩室引起，必要时也需要手术治疗，解除下尿路梗阻，改善男性分段排尿的症状。