尿道口囊肿可能为先天性因素所导致，比如尿道旁腺管口发育异常，容易导致尿道旁腺管口出现堵塞，分泌物不能及时排出，就会积聚于管腔内，久而久之就会形成囊肿。
如果是后天性的尿道口囊肿，可能是感染因素所引起。因为尿道旁腺与尿道外口相邻，如果不注意尿道口部位的卫生，就会导致尿道旁腺出现感染，从而使腺管管腔堵塞，就可导致尿道口囊肿。
如果尿道口囊肿较小，没有引起任何临床症状，一般不需要进行治疗。如果囊肿体积较大，影响到了日常的排尿，可考虑进行手术切除。