舌头两边起泡有多种原因，可能是感染病毒引起的症状。多数口腔内部被病毒感染的患者会长出很多单纯性疱疹，像小水泡一样成簇生长，可能会有些疼痛、肿胀的症状。如果疱疹溃破以后还会形成溃疡面。
也可能是饮食温度过高的食物对舌头两侧的组织出现烫伤引起，此时出现的是血泡，与温度升高刺激血管，导致血液淤积有关。
还可能是因为牙齿的生长异常，需要矫正牙齿，牙齿上佩戴矫正的附件，与舌头两侧产生较重的摩擦引起的水泡。