手指甲分层多数是下列几种原因所致：
1.外伤。比如手指甲不小心被砸伤，容易导致指甲分层，一般局部可能还会有瘀血或肿胀现象。在处理好伤口之后，一般会有新的指甲慢慢生长出来。
2.甲营养不良。此病和多种原因有关，和遗传性因素或先天性因素有关，也有可能是银屑病或湿疹等皮肤疾病造成的。会使患者出现指甲分层，有的患者指甲可能会变厚或变薄、易脆或变形。
3.灰指甲。此病主要是由于真菌感染而造成的，会使指甲浑浊或增厚，有的会分离、翘起。