军团病的病死率约为15%，年龄越大，病死率越高，有基础疾病或免疫缺陷者病死率更高。死亡原因多数为呼吸衰竭，其次为休克和急性肾功能衰竭，如能早期诊断，积极有效治疗，病死率可以降低。
对于军团病可以通过以下方法进行预防。
饮水消毒、加氯或煮沸可杀灭病菌。对空调系统应予关闭，进行消毒清洗。
对于供水系统使用器材、喷雾器等进行卫生管理。
可通过预防措施处理军团病造成的公共卫生危险，虽然不可能根除传染源，但可以显著减少风险。
军团病的预防依赖于对可能感染源的良好管理，包括定期清洗和消毒以及采用其他物理和化学措施。尽量减少细菌生长，如对冷却塔定期进行清洗和消毒，并经常或不断添加生物杀灭剂。在温泉池中保持足够水平的氯等生物杀灭剂，并至少每周完全排水一次清洁整个系统。在医院，工业场所，旅馆，休闲中心等采用这些措施可极大的减少军团菌污染的可能性，并预防散发病例的发生。