因为肾上腺性征异常症是一种先天性的疾病，也可以因为某种基因突变或者是基因缺失而导致疾病生成。所以主要是对于一些疾病并发症的产生进行预防。
本病的治疗主要分为保守治疗和手术治疗。其中保守治疗最主要为激素替代性治疗。因为本病的致病原因，可能是因为基因突变导致一些酶类缺失，所以会出现激素水平的不足。
所以补充激素是对于本病的主要治疗，并且能预防某些并发症的出现。手术治疗一般是在于一些出现了两性发育的畸形的矫正，以及对肾上腺肿瘤的切除。