一上厕所就觉得尿道痛，应当先确定病因，再进行治疗。
如果是急性尿路感染疾病所导致的排尿疼痛，比如急性尿道炎或者膀胱炎，一般还伴有尿频尿急的症状，在确诊以后应及时地使用抗菌性的药物予以治疗。比如左氧氟沙星、阿莫西林等，随着炎症感染的逐渐消退，排尿疼痛的症状也会逐渐消失。
如果是尿道结石所导致的尿道疼痛，一般还伴有尿不尽、排尿困难、血尿等症状，当结石无法自行排出时，可以考虑进行碎石术，在碎石后，患者也要大量饮水，勤排尿，促进碎石排出。