化脓性肉芽肿一般在治愈以后有可能会留疤。因为这种皮肤损害大多伤及到真皮层，并且形成明显的皮肤软组织增生，特别是形成了真皮组织内的毛细血管增生。所以化脓性肉芽肿在平时就可能看到明显的出血现象。
一般这种疾病的治疗主要是采取物理治疗或者是激光的治疗方式来进行去除。如果是物理治疗，一般可以通过这种激光的热作用烧除原来的病变肉芽肿的组织，让这些皮肤组织重新的生长，不过在生长过程中可能会遗留有一定的疤痕。
如果这种肉芽肿较大，就需要进行手术切除治疗，而手术切除一般也会造成一定的疤痕。