器质性和功能性的阳痿，主要区别有三点：
一、发病的进展速度，前者器质性的阳痿，发病较为缓慢，有较长的持续时间过程并且阳痿症状会逐渐加重，而后者功能性的阳痿发生都比较突然。
二、可以从病因进行区别，器质性的阳痿多见的是生殖器发育缺陷，阴茎、睾丸发育畸形异常外观等而功能的阳痿，一般跟精神、心理因素关系是比较密切的。
三、观察勃起的状态，器质性的阳痿，无论在任何条件的刺激下，通常都是不能正常勃起的；而功能性的阳痿，可能在某一时段能够正常的勃起，而在某一时段有可能会出现阳痿的症状。