右肾疼痛最常见的原因包括急慢性肾盂肾炎、肾结石以及肾囊肿和肾肿瘤等。病人表现为右肾疼痛，通常考虑的第一个原因就是病人有没有肾盂肾炎。肾盂肾炎分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎这两大类。急性肾盂肾炎的患者会有腰部的锐痛，但同时也会伴有寒战、发热，有些病人还会有尿频、尿急、尿痛等症状。慢性肾盂肾炎腰部的疼痛是以钝痛为主，有的病人可能也不会表现为疼痛。这个时候主要是给病人做尿常规和尿培养的检查，来帮助判断。
导致右肾疼痛的原因第二个常见的原因就是泌尿系的结石。大的结石在局部移动度不大，所以疼痛没有明显。但是小的结石移动起来可以引起锐痛，甚至引起输尿管痉挛而出现肾绞痛。
另外，像肾囊肿或者肾肿瘤，也有可能会导致肾脏的疼痛，但这种通常见于比较大的囊肿和肿瘤。