生理性肠鸣不需服用药物，病理性因素引起的结合医生的意见用药。
食物摄入后肠道里面的水、空气、食物的混合物，在肠道蠕动内时会发出肠鸣音，正常情况下每分钟肠鸣音可能有4-5次，一般不容易被察觉到。如果到了吃饭时间，还没有食物摄入也会导致肠鸣音，需要及时摄入食物可减少肠鸣音，此乃生理因素导致一般不需药物治疗。
急性肠胃炎的患者胃肠道蠕动过快，也会出现肠鸣音亢进的表现，需要结合医生的意见口服蒙脱石散、诺氟沙星、胃复安、黄连素等药物，能缓解症状。肠道功能紊乱、肠道菌群失调需要使用促进胃动力、调节肠道菌群的药物，如双歧杆菌、吗丁啉等。