抗甲状腺微粒体抗体升高和抗甲状腺球蛋白抗体升高，这个临床意义是相似的。
抗甲状腺微粒体抗体升高，提示存在着自身免疫性甲状腺疾病；抗甲状腺微粒体升高，如果和抗过氧化物酶抗体同时升高，提示桥本甲状腺炎的可能性大；如果抗甲状腺微粒体和促甲状腺激素受体抗体同时升高，能够提示弥漫性毒性甲状腺炎的可能性更大。
如果仅仅有甲状腺微粒体抗体升高，甲状腺功能也是正常的，一般无需特殊处理，只需要定期随访甲状腺功能的变化以及其他抗体的变化即可，最终是根据甲状腺功能的情况给予相应的治疗。