肠套叠的治疗方法根据疾病的病因、病情的程度以及患者的自身状况，治疗方式也是不同的。
儿童出现肠套叠大多是由于感染、饮食不良、腹泻等原因引起的。如果儿童出现腹痛、呕吐、出现果酱性大便就需要及时做彩超检查，然后可以通过气体或者钡剂灌肠的方法治疗，大部分不需要手术，保守治疗就可以恢复。如果保守治疗无效，可以采用手术的方法治疗，避免发生肠道缺血、坏死的情况。如果套叠时间长已经发生了肠道的坏死，还需要切除部分肠管。