肾结石碎石后还是疼可能是碎石本身引起的疼痛、碎石没有完全排出体外、肾盂肾炎引起的。
1.碎石本身引起的疼痛。肾结石碎石是利用超声波将能量经过皮肤传到体内，直接冲击在肾结石上，把结石打碎，能量比较大。即使在碎石后，患者的感觉神经仍会受到刺激出现疼痛，一般不需特殊处理，休息即可。
2.碎石没有完全排出体外。如果患者的肾结石较大，碎石后碎成小结石，卡在了输尿管或者尿道的位置，导致肾绞痛发作。
3.肾盂肾炎。在碎石后继发了细菌感染，会出现肾盂肾炎，细菌的代谢产物堆积，致使患者出现疼痛感。