急性附睾炎继发于其他的下尿路感染之后，所以，在急性附睾炎发作时应确定是什么疾病导致的附睾炎。附睾炎发作时，首先应针对病原体的感染及细菌培养的结果，选择比较合适的敏感抗生素。
一般情况下选用广谱的抗生素，此外需要患者平卧休息、抬高阴囊，局部应用止痛药物等治疗。
患者还可以应用一些中医药治疗，如果附睾炎导致脓肿形成，需要切开引流脓液。如果能找出附睾炎发作的原发性疾病，应该同时对该原发疾病进行治疗。此外急性附睾炎治疗期间饮食清淡，禁食辛辣刺激性的食物。