查不到头痛的原因，主要以对症治疗为主。
首先，如果患者完善了相关的辅助检查，没有明确的病因，可以排除器质性疾病所引起的头痛原因如下，例如脑出血、颅内肿瘤、颅脑外伤、脑膜炎等。患者主要考虑是血管神经性头痛所引起的，发病以后主要以口服止痛药物对症治疗为主。
其次，头痛查不到原因还应注意观察病情，每年定期地复查。如果是考虑神经性头痛所引起的，建议应记录头痛的规律，对将来采取进一步的明确诊断和治疗是有好处的。
不明原因的短期头痛，可在专业医生指导下应用对症止痛药物，如布洛芬等。