肛周脓肿术后初期，憋不住大便可以暂时观察治疗。若切口完全愈合后，症状无任何的好转，应及时到肛肠科就诊。
肛周脓肿是由于肛腺感染引起的，确诊后应及时行肛周脓肿根治术，术中通常会将感染的肛腺切除，将脓腔充分敞开。如果范围较大的肛周脓肿，术后初期由于肛门周围软组织缺损较多，可能会导致暂时憋不住大便。等脓腔内的脓液及腐败组织引流干净，长出新鲜的肉芽组织填充缺损的组织后，这种症状通常可以改善或者痊愈。
部分患者可能由于术中操作不当，导致肛门直肠环损伤较大，从而引起真性的肛门失禁，则需要行二次手术治疗。