首先肾积水主要是由于泌尿系统的梗阻导致肾盂与肾盏扩张，其中潴留尿液，统称为肾积水。一般来说肾积水有分为原发性和继发性两种。原发性的肾积水主要是因为肾盂输尿管连接部的梗阻，它往往是由于这个部位的肌细胞被大量胶原纤维分离，失去了正常的排列，不能有效的传递来自起搏细胞的电活动，阻断了正常蠕动的传送。也有一些先天性肾积水是因为机械性梗阻导致的，例如异位血管、纤维条索、输尿管肾盂高位插入、肾盂输尿管连接部狭窄或者瓣膜膜性粘连造成的局部输尿管迂曲等。对于继发性的肾积水，多数是由于泌尿系的其他疾病导致的，例如上尿路的梗阻性病变、肿瘤、息肉、结石、结核、炎症损伤、畸形、肾下垂等。也可见于一些下尿路梗阻性病变，例如前列腺增生症、前列腺癌、尿道狭窄、膀胱输尿管反流等。