贲门癌手术后的并发症是比较多的，但是目前采取手术治疗的并发症发生的概率比较低，贲门癌手术存在两种方式：一种为左经胸贲门癌根治术，另外一种为经腹部贲门癌根治术。
术后的并发症有：吻合口瘘、肺部感染、肺不张、吻合口狭窄、肠粘连、肠梗阻、肠瘘、切口感染、腹腔盆腔感染、脑梗塞、脑出血、双下肢静脉血栓、药物过敏、术后出血等，贲门癌术后需要做个病理，进一步的明确疾病的分期及分化程度。
对于贲门癌中、晚期术后是需要积极采取化疗、放疗治疗，而对于贲门癌早期术后是不需要治疗，但是需要定期复查。