染色体异常会引起习惯性流产。目前已经有足够的临床研究表明，发生习惯性流产和自然流产的主要病因就是胎儿染色体异常。其中导致胎儿染色体异常，有可能跟父亲精子染色体异常以及母亲卵子发育不良有相关性。
对于习惯性流产，首先一定要查找病因。若目前处于流产期间，建议针对胎儿胚胎组织进行染色体检查。若已错失时机，可以对夫妇双方染色体进行检查并进行遗传学分析。
除此之外，还要查男性精液有没有存在弱精症和死精症，查女性有无先天子宫宫颈管畸形或者宫颈是否存在机能不全。查明习惯性流产原因，针对原因进行治疗。