腱鞘囊肿可以做核磁共振检查。核磁共振检查下，不但能够显示出腱鞘囊肿的具体位置、大小、形态，还能够看到腱鞘囊肿与关节腔相通的大概位置，是非常准确的一种检查方式。
由于核磁共振检查对于软组织的分辨率比较高，所以对于腱鞘囊肿以及腱鞘囊肿与周围组织的关系方面，判断的非常准确。但是，一般不会让患者做核磁共振检查。
因为腱鞘囊肿是一种比较浅表的病变，做超声检查基本上就可以判断了。而且超声检查对患者的要求比较少。操作起来也比较简单、方便，价格也比较低。所以，腱鞘囊肿首选超声。