长期腹泻能否根治要看导致腹泻的原因。
如果是肠道功能性病变导致的长期腹泻，比如肠易激综合征，当患者调整心理状态，避免紧张、焦虑，同时调整饮食结构，饮食上做到清淡易消化，不吃辛辣、刺激的食物后一般能根治。如果是慢性肠炎导致的长期腹泻，调整饮食结构后也能根治。
如果是溃疡性结肠炎、克罗恩病等和自身免疫相关的疾病导致的长期腹泻，一般很难根治，但用药能够较少疾病发作的频率，延缓疾病进展，这类疾病常用美沙拉嗪治疗，克罗恩病还可以用一些免疫抑制剂治疗比如环孢素。