疖肿和毛囊炎，可以通过以下几点进行区分：
毛囊炎主要出现在毛发部位，多为头部和面部出现，而疖肿生长部位却不固定，头部、面部、颈部、背部和四肢都可能存在。由于毛囊炎丘疹只长在毛囊部，损害对象仅仅单根毛发，所以其形状较小，脓疱交浅，而疖肿是因为毛囊被葡萄球菌侵入，引起的急性化脓性感染，并且会在周围皮肤形成红肿，所以疖肿一般大而深。
疖肿的中心会出现黄绿色脓头，而毛囊炎不存在这种情况。毛囊炎可能出现疼痛、瘙痒，也可能无主观感觉，但是疖肿疼痛明显、剧烈。