基质性角膜炎与单纯疱疹病毒性角膜炎都是眼科常见疾病，但是两者是有区别的。单纯疱疹病毒性角膜炎是由于单纯疱疹病毒感染角膜之后，由于病毒本身的破坏，引起的角膜炎症。主要的表现是眼睛充血，发红，刺痛，异物感，怕光，流泪，不愿意睁眼，频繁眨眼等。
角膜上的病灶为树枝状或地图状，局部角膜上皮缺损，角膜基质出现浸润。而基质性角膜炎则是由于病毒感染角膜之后引起的免疫反应造成的炎症。眼部的主要症状是充血、发红、视力下降。角膜病灶的形态特点为角膜基质中出现圆盘状的浑浊与水肿。因此，两者在形成机制、外观上都是有明显区别的。