咳嗽、发烧不退的原因有很多，临床上更多见于肺部感染的患者，例如由细菌感染下呼吸道引起肺炎或肺脓肿，患者可以出现反复发烧和咳嗽等症状，特别是肺炎伴有脓毒血症时，常可以出现发烧不退的症状。
此外，还可以见于由病毒感染呼吸道引起的病毒性肺炎。另外，某些非感染性疾病也可引起咳嗽、发烧不退，例如结缔组织病、淋巴瘤，或白血病肺部浸润时，也可以产生咳嗽和发烧不退的症状。
故对于咳嗽、发烧不退时，多需要完善相应的检查，特别是血常规、胸部X线，或CT等检查来明确原因。对于咳嗽、发烧不退的患者一定要针对病因予以相应的治疗，才能更好地控制其临床症状。