化脓性角膜炎患者，可以服用一些抗生素类药物，或者抗病毒类的药物进行治疗。
化脓性角膜炎一般是由于病原微生物感染角膜导致，针对病原体类型的不同，需要采取不同的药物进行治疗。对于细菌感染，最有效的方式是应用抗生素进行治疗，抗生素能抑制细菌的生长繁殖。在自身免疫力的作用下能够清除细菌，实现角膜炎的治愈。对于病毒感染，抗病毒药物更为有效，抗病毒药物能抑制病毒繁殖。
如果化脓性角膜炎比较严重，出现角膜穿孔，如果要进行角膜移植，可能还需要服用减轻排斥反应的药物。