嗓子里出现长疱的情况，有可能是出现病毒性疱疹，常见的是肠道病毒感染引起疱疹性咽峡炎的病情。常通过呼吸道途径或者粪-口途径传播感染，也可能和自身免疫力下降有关。这种病毒性疱疹常会导致较为剧烈的咽痛症状，还会引起持续发热的表现。
部分也可能出现咽喉后壁黏膜表面有淋巴滤泡增生隆起的情况，往往和咽喉部急慢性炎症相关。也常和长期持续过度用嗓、过度烟酒、辛辣饮食、长时间处于空气污染的环境等有关，这种淋巴滤泡的增生常会引起异物感、疼痛感、干燥等不适症状。