室间隔缺损最根本的治疗方法是进行手术治疗，医生会根据缺损的大小、位置选择合适的手术方法。
室间隔缺损的患者吃药治疗能够缓解症状，但是不能够根除，室间隔缺损是因为在胎儿时期母体受到病毒感染或者其他原因引起的两个心室之间的间隔没有发育完善，留有了空隙，所以这样的患者需要进行手术，把这个缺损给补上，才能够彻底的根治。
室间隔缺损的患者手术成功后可以有正常的生活、工作、生育能力。