百日咳患者多发生于5岁以下的婴幼儿，婴幼儿的百日咳患者一般需要输液治疗。青少年和成人患者，可以接受口服药物的治疗。婴幼儿的患者输液治疗，通常包括静脉补液治疗以及抗生素的治疗。
百日咳是由百日咳杆菌引起的呼吸道传染性疾病，所以需要使用抗生素来治疗。一般会选择大环内酯类的抗生素，如红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等。
输液治疗的疗程通常在2周左右，早期使用抗生素治疗能够有效的杀灭百日咳杆菌，有助于缩短病程，加速疾病的康复。