泌尿系统感染时，药物的选择主要根据感染的致病菌种类来决定。临床上最为常见的泌尿系统感染是由革兰氏阴性细菌感染引起，这类患者通常选用抗革兰氏阴性菌，效果较强的喹诺酮类，或第三代头孢菌素类抗生素，如左氧氟沙星或头孢他啶等药物。
有部分患者尿路感染是由支原体或衣原体感染引起，这类患者需要选择大环内酯类的抗生素，如罗红霉素等。还有少部分患者是由结核杆菌引起的感染，患者则需要选择联合抗结核药物治疗，常用的药物有异烟肼、利福平和吡嗪酰胺等。
所以，当患者出现泌尿系统感染时，需要及时到泌尿外科就诊，完善尿常规及细菌培养，根据检查结果选择敏感药物治疗，同时患者需要多饮水。