通常情况下，自闭症孩子智力是不正常的。
其中真性自闭症也称为器质性自闭症，是由于基因突变造成大脑器质性的病变，导致患儿一些思维功能缺失。甚至会失去思维功能，无法具有归纳、分析、判断等逻辑思维能力。虽然长相上与正常人没有什么区别，但可能会出现终身智力低下。
假性自闭症又叫功能性自闭症，是指患儿大脑思维区域没有器质性病变，思维能力是正常的。是由于后天某项能力发展不平衡而导致智力的缺失，具有正常的思维能力，与真性自闭症有本质区别，某些天才就会出现假性自闭症的表现。