撒尿的时候尿道刺痛的原因如下：
1.急性尿道炎。由于尿道部位存在炎症反应，炎性产物会对尿道黏膜形成刺激，造成尿道黏膜水肿，甚至出现糜烂现象。在排尿时会对水肿、糜烂的尿道黏膜产生刺激，进而引起尿道刺痛感，还可伴有尿道灼热感以及尿频、尿急等表现。
2.泌尿道损伤。由于在生活或工作当中受到意外伤害，造成尿道损伤，致使尿道黏膜破损，也会导致排尿时出现尿道刺痛，还可出现尿道异物感。
3.尿道结石。部分结石经由尿液冲刷会产生移动，在结石移动时很可能会划伤尿道黏膜，也会引起排尿时尿道刺痛。