睡觉会咳嗽咳醒多与气道反应性高，或者呼吸道感染有一定的关系，症状严重时可以适当服用一些镇咳药物，比如甘草片、咳必清等。
如果存在呼吸道感染，需要进一步到医院完善痰培养、血常规以及胸片等检查，根据病原菌的类型，选取适合患者自身的敏感抗生素进行抗感染治疗。另外，如果是由于气道反应性高导致，可以在睡觉前口服孟鲁司特钠等药物，来改善咳嗽的症状。
除此之外，睡觉时经常被咳嗽咳醒，也有可能存在张口呼吸的现象。如果患者有鼻甲肥厚或者鼻塞的情况，就有可能会引起张口呼吸。一旦干燥的空气进入口腔当中，就容易导致刺激性咳嗽，最好及时到医院查明病因，并采取针对性治疗。