咽畸胎瘤多见于婴幼儿、儿童、青少年以及25岁以下的女性。本病是发源于多胚层组织的先天性肿瘤，应尽早行手术切除治疗。
对于良性畸胎瘤彻底切除肿瘤即可，并不需要再进行其它特殊处理。但是若为恶性畸胎瘤，则应按照恶性肿瘤的治疗原则，要适当的扩大切除范围。术中还要根据病变部位进行修复，同时应结合化学治疗，术后要注意定期复查随访。
一般良性畸胎瘤术后的远期效果好，而且复发率也低，但是恶性畸胎瘤的恶性越高时则预后越差。平时用盐水漱口，不要吃辛辣、刺激性的食物。