睾丸畸形所做的检查项目主要包括：体格检查、 CT、磁共振、放射性核素、激素检查、腹腔镜检查、探查等。
通过体格检查，能够确定男性单侧或双侧睾丸的大小、位置、数目等是否出现了异常；通过激素检查，能够确定是否存在睾丸缺如、隐睾、异位睾丸等情况，也能够确定睾酮水平是否正常；通过CT、磁共振等检查，能够进一步的确诊睾丸畸形；放射性核素检查，能够对睾丸定位、定性，做出明确判断；腹腔镜检查，能够了解腹腔内是否存在睾丸或者是隐睾的情况，同时还能够进行相应的治疗。
通过以上检查进行综合判定，可确诊为睾丸畸形。