目前临床上关于脂蛋白肾小球病，没有非常有效的治疗手段，主要是针对脂蛋白肾小球病的临床表现，进行相应的药物治疗。
由于大部分脂蛋白肾小球病合并高血压，所以控制血压是一个治疗的重要措施。使用的药物主要是血管紧张素转换酶抑制剂或者血管紧张素受体拮抗剂，也可以联合使用其它类药物，比如钙离子通道阻滞剂。使用他汀类的药物降血脂治疗可以起到一定的降低尿蛋白的作用。
如果药物治疗效果不好的情况下，也可以使用免疫吸附降低血脂。如果水肿明显的情况下，可以适当使用一些利尿剂，比如氢氯噻嗪或螺内酯，还要控制患者盐和水的摄入。