淋球菌性结膜炎属于化脓性结膜炎的一种，两者并不等同。
淋球菌性结膜炎一般特指结膜受到淋球菌感染后所发生的炎症，而化脓性结膜炎指的是所有能够引起眼部出现脓性分泌物的结膜炎症。
化脓性结膜炎包含多种类型，如细菌性结膜炎、衣原体结膜炎等。所感染的病原微生物有肺炎球菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、沙眼衣原体等，也包括能够引起淋球菌性结膜炎的奈瑟淋球菌。
淋球菌性结膜炎与化脓性结膜炎的主要特征是眼部会分泌大量的脓性分泌物，且会造成患者眼部的疼痛。化脓性结膜炎有急性与慢性之分，淋球菌性结膜炎一般是一种超急性的炎症。