金莲花主要的副作用有可能是会伤及人体的脾胃。金莲花味苦性寒，属于临床上常用的一种清热解毒的中成药，尤其对于咽喉炎、扁桃体炎引发的咽喉肿痛症状效果比较明显。
正常人在正常服用剂量内，患者出现副作用的可能性很小。如果过量服用有可能会导致患者出现一系列消化不良表现，比如腹痛、腹泻、恶心、呕吐等症状。患者如果本身属于脾胃虚寒体质，建议在医生指导下使用上述药物，正常服用剂量也有可能会导致患者肠胃病情加重。
另外对于存在宫寒的女性患者或者在女性的生理期期间，建议还是尽量不要服用上述药物。