肺脓肿不是必须手术治疗。肺脓肿的治疗包括抗菌药物使用、脓液引流、手术治疗。
首先抗菌药物使用。对于吸入性肺脓肿多为厌氧菌感染，可给予青霉素或者克林霉素。对于血源性的肺脓肿，多有葡萄球菌、链球菌感染所致，可给予β-内酰胺类的青霉素或者头孢菌素应用。对于耐甲氧西林葡萄球菌，可给予万古霉素。
脓液引流可以有效提高疗效，可以通过化痰、雾化、体位引流、支气管镜冲洗、吸痰等方法。
手术治疗主要用于肺脓肿病程长、内科治疗无效、脓腔过大不易闭合、支气管阻塞无法引流等情况下。